Chemtool(How to draw chemistry):MOST/cs

▼Otevřená laboratoř udržitelných technologií Michigan Tech

Kontaktujte Dr. Joshuu Pearce ve společnosti Free Appropriate Sustainable Technology

MOST · Projekty a publikace · Metody · Literární recenze · Lidé · Sponzoři · Novinky · Aktualizace na Twitteru · YouTube

úvod

Odkaz na vývojovou stránku s různými verzemi a popisy. Verze 1.6.15 je v době psaní této stránky s metodami nejaktuálnější.

V literatuře: Rigidita receptoru a mobilita ligandu v komplexech trypsin-ligand

Chemtool je užitečný program, když je potřeba vytvářet modely molekul pro vědecké práce. I když je možné kreslit a označovat složité molekuly, Chemtool má také vestavěné šablony, které tento proces usnadňují. Konkrétně pro karbocykly, cukry, heterocykly a aminokyseliny.

Chemtool dokáže uzamknout různé úhly vazeb, překrýt text, otáčet a kopírovat již vytvořené molekuly a vypočítat molekulovou hmotnost.

instalace

1. Jděte sem a klikněte na odkaz pro stažení

1. Jakmile se soubor .zip stáhne, přesuňte jej do příslušného adresáře a rozbalte jej.

1. Chemtool není nutné instalovat, stačí spustit soubor Chemtool.exe.

Vysvětlení použití

Toto je stručný přehled programu. Obecně platí, že kliknete na tlačítko, na které chcete změnit ukazatel myši, a poté kliknete na obrazovku s požadovanou akcí.

1. Prvních 5 tlačítek (1-5) zleva umožňuje nastavit změnu úhlu uhlíkového řetězce, pokud jsou vybrána.
2. Další tři tlačítka (6-8) označují změnu orientace textu při jeho přidání: zarovnání doleva, doprostřed nebo doprava.
3. Tlačítko 9 umožňuje změnit písmo textu (tučné nebo normální)
4. Tlačítko 10 umožňuje zobrazení různých obrazů vazeb při spojování atomů, přičemž se budou používat primárně jednoduché, dvojné nebo trojné vazby.
5. Tlačítko 11 umožňuje změnu zbarvení vazeb mezi atomy pro barevné kódování
6. Tlačítko 12 umožňuje upravit vytvořený typ vazby pomocí tlačítek (1-5) výběrem vazby z tlačítka (10).
7. Tlačítko 13 umožňuje označit molekuly nebo jejich části. Molekuly musí být označeny, než s nimi lze manipulovat pomocí následujících 8 tlačítek (14-21).
8. Tlačítko 14 lze použít k překladu molekul nebo jejich částí
9. Tlačítko 15 lze použít k otáčení molekul nebo jejich částí
10. Tlačítka 16 a 17 lze použít k horizontálnímu nebo vertikálnímu otočení označených molekul nebo jejich částí.
11. Tlačítko 18 lze použít ke kopírování označené molekuly nebo jejích částí.
12. Tlačítko 19 lze použít k úpravě velikosti molekul.
13. Tlačítko 20 lze použít k vytvoření několika druhů závorek kolem označené molekuly nebo jejích částí.
14. Tlačítko 21 lze použít k odstranění duplicitních vazeb a obecně se používá k čištění molekul pro publikování.
15. Textový panel pod tlačítky je přístupný pro vložení textu přes nakreslené chemické vzorce.
16. Až budete s výkresem spokojeni, exportujte ho jako bitmapový obrázek, a pokud to nefunguje, udělejte snímek obrazovky.

• Podrobný popis všech funkcí programu naleznete v souboru using_chemtool.html v nainstalovaném adresáři.

vypnutí

1. Po exportu (uložení) vytvořené molekuly jednoduše zavřete program